Windows 2000 Terminal Hizmetleri uygulama sunucusu modunda etkinleştirildiğinde bazı uygulamalar en iyi durumda çalışmak için değişiklikler gerektirir. Microsoft ve bu komut dizilerinin sağlayıcıları bir uygulamanın her bileşeninin bir terminal sunucuda doğru çalışması için ellerinden geleni yapmalarına karşın bazı sorunların çözülmesi için uygulamanın geliştiricisine başvurmak gerekebilir.
Power Builder 6.0, Terminal Hizmetleri'ni Uygulama Sunucusu modunda çalıştıran bir Windows 2000 Server'a kurulduğunda uygulama, birden çok kullanıcıyı desteklemediğinden kurulum sonrası küçük değişiklikler gerektirmektedir. PowerBuilder 6.0, PowerBuilder 6.0 klasöründeki Code Examples'ı aynı anda çalıştıran birden çok kullanıcıyı desteklememektedir.
Not PowerBuilder 6.0'da herhangi bir kullanıcının yaptığı herhangi bir özelleştirme, tüm PowerBuilder 6.0 kullanıcılarını etkiler.