Wenn Windows 2000-Terminaldienste im Anwendungsservermodus aktiviert werden, sind möglicherweise Änderungen am Setup erforderlich, damit einige Anwendungen optimal funktionieren. Microsoft und der Anbieter dieser Skripts bemühen sich intensiv darum, das ordnungsgemäße Funktionieren aller Anwendungskomponenten auf einem Terminalserver sicherzustellen. Unter Umständen kann es jedoch notwendig sein, zur Behebung bestimmter Probleme den Entwickler der Anwendung zu konsultieren.
Wenn Eudora 4.0 auf einem Windows 2000 Server installiert wird, bei dem Terminaldienste im Anwendungsservermodus aktiv sind, erfordert die Anwendung nach der Installation geringfügige Änderungen, da Eudora 4.0 keinen Mehrbenutzerbetrieb unterstützt. Dieses Update ändert die Standard-Registrierungsberechtigungen dahingehend, dass Benutzer ohne Administratorrechte SmartSuite 9 (Millennium Edition) ausführen und zu Usrlogon.cmd das Skript Ss9usr.cmd hinzufügen können.