Si les services Terminal Server de Windows 2000 sont activés en mode Serveur d'applications, vous devez modifier la configuration de certaines applications pour un fonctionnement optimal. Malgré les efforts déployés par Microsoft et le fournisseur de ces scripts pour garantir le parfait fonctionnement de chacun des composants d'une application sur un serveur Terminal Server, il peut s'avérer nécessaire de contacter le développeur de l'application pour résoudre certains problèmes.
Lorsque Eudora 4.0 est installé sur un serveur Windows 2000 exécutant des services Terminal Server en mode Serveur d'applications, l'application nécessite des modifications mineures après l'installation car Eudora 4.0 ne prend pas en charge plusieurs utilisateurs concurrents. Cette mise à jour modifie les droits d'accès par défaut au Registre qui permettent aux utilisateurs qui ne disposent pas de droits d'administrateur d'exécuter SmartSuite 9 (Millennium Edition) et d'ajouter le script ss9usr.cmd à usrlogon.cmd.